POTENSI GETAH PEPAYA LOKAL SEBAGAI ALTERNATIF PROTEINASE-K PADA ISOLASI DNA BAKTERI Klebsiella pneumoniae DALAM MENUNJANG PEMERIKSAAN PCR

Infeksi nosokomial merupakan masalah kesehatan di rumah sakit yang dapat meningkatkan morbiditas, mortalitas, dan biaya pelayanan kesehatan. Klebsiella pneumoniae menjadi salah satu bakteri penyebabnya sehingga diperlukan metode deteksi yang cepat dan akurat seperti PCR. Keberhasilan PCR bergantung pada kualitas DNA hasil isolasai. Proteinase-K digunakan untuk menghilangkan protein pengganggu dalam isolasi DNA, namun memiliki keterbatasan sehingga diperlukan alternatif lain. Papain dari getah pepaya mentah memiliki aktivitas proteolitik yang berpotensi sebagai alternatif Proteinase-K. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui kualitas isolat DNA genom K. pneumoniae menggunakan enzim Papain dari getah pepaya lokal dan mengevaluasi kemampuannya dalam amplifikasi PCR. Penelitian ini menggunakan desain eksperimental komparatif dengan pendekatan kualitatif dan kuantitatif. Dalam proses isolasi DNA, Papain digunakan sebagai perlakuan, sedangkan Proteinase-K digunakan sebagai kontrol pembanding. Kualitas DNA yang dihasilkan, dinilai melalui pengukuran kemurnian dan konsentrasi menggunakan spektrofotometer UV-Vis pada panjang gelombang 260 nm dan 280 nm, serta divisualisasikan melalui elektroforesis gel agarosa. Nilai rata-rata kemurnian DNA pada perlakuan Papain dan Proteinase-K masing-masing sebesar 1,03 ± 0,00 dan 1,02 ± 0,01. Sementara itu, rata-rata konsentrasi DNA masing-masing sebesar 195 ± 0,00 ng/μl dan 196,25 ± 6,29 ng/μl. Hasil elektroforesis pada produk PCR menunjukkan fragmen DNA 209 bp. Kesimpulannya, Papain dari getah pepaya mentah menghasilkan kualitas DNA yang sebanding dengan Proteinase-K berdasarkan kemurnian, konsentrasi, dan visualisasi pita DNA, sehingga berpotensi digunakan sebagai alternatif dalam isolasi DNA genom K. pneumoniae.