Seto, Bayu Giri Nur (2026) STUDI IN SILICO SENYAWA EKSTRAK DAUN RAMBUSA (Passiflora foetida L.) SEBAGAI INHIBITOR PBP2a PADA Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus. Other thesis, Universitas dr. SOEBANDI.
Abstrak Bayu.pdf
Download (541kB)
Abstract
Latar Belakang : Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) merupakan ancaman kesehatan global akibat resistensinya terhadap sebagian besar antibiotik golongan β-laktam yang dimediasi oleh Penicillin-Binding Protein 2a (PBP2a), sementara potensi ekstrak daun rambusa (Passiflora foetida L.) sebagai inhibitor PBP2a belum banyak dikaji.
Tujuan : Penelitian ini bertujuan mengetahui karakteristik fisikokimia, farmakokinetika, dan toksisitas, serta interaksi senyawa aktif ekstrak daun rambusa (Passiflora foetida L.) dengan reseptor PBP2a pada MRSA menggunakan metode in silico.
Metode : Senyawa hasil LC-HRMS diseleksi dengan Lipinski’s Rule of Five, kemudian di docking terhadap PBP2a (PDB ID : 4CJN) menggunakan AutoDockTools 1.5.6 dan PyRx 0.9.8, dengan ceftaroline sebagai kontrol positif. Interaksi ligan-reseptor divisualisasikan dengan BIOVIA Discovery Studio 2024, sedangkan profil farmakokinetika dan toksisitas diprediksi menggunakan pkCSM dan Tox-Prediction.
Hasil : Dari 554 senyawa hasil LC-HRMS, 283 senyawa memenuhi Lipinski’s Rule of Five. Validasi docking menghasilkan RMSD 0,86 Å. Virtual skrining menyeleksi enam senyawa terbaik berdasarkan binding free energy (BFE) dan kesamaan interaksi residu dengan native ligand/ceftaroline. Hydroxy-Oxoandrostanyl Acetate menunjukkan BFE terbaik (-8,72 kkal/mol), diikuti Alcyopterosin C (-7,71 kkal/mol), keduanya melampaui ceftaroline (-7,67 kkal/mol), sedangkan Scytoscalarol (-7,51 kkal/mol) setara dengan native ligand (-7,51 kkal/mol). Keenam senyawa memiliki profil farmakokinetika dan toksisitas yang cukup baik.
Kesimpulan : Temuan ini menunjukkan bahwa ekstrak daun rambusa berpotensi sebagai kandidat inhibitor PBP2a pada MRSA, sehingga dapat menjadi dasar pengembangan kandidat antibakteri baru.
| Item Type: | Thesis (Other) |
|---|---|
| Subjects: | R Medicine > RS Pharmacy and materia medica |
| Depositing User: | Unnamed user with email perpustakaan@stikesdrsoebandi.ac.id |
| Date Deposited: | 30 Sep 2026 02:49 |
| Last Modified: | 30 Sep 2026 02:49 |
| URI: | https://repo.uds.ac.id/id/eprint/3386 |
